我們身體中的許多細胞類型以一種模糊的方式工作，這并沒有被科學完全理解。這也適用于免疫細胞，這對保護我們免受嚴重疾病的侵害非常重要。
為了克服這一障礙，研究人員做了大量的努力來尋找研究單細胞內(nèi)功的新方法。
“挑戰(zhàn)不僅僅是從組織樣本中分離出單個細胞。我們?nèi)匀恍枰业揭环N方法來確定單個細胞的功能，”生物化學和分子生物學系助理教授兼首席研究員Kedar Nath Natarajan說。南丹麥大學。
在由韋爾科姆桑格研究所的凱達納特納塔拉詹和陳曦領導的一項新研究中，一個研究小組開發(fā)了一種對器官和組織中的微小單細胞進行顯微分析的新方法。
這種新方法可以分析來自脾臟的3000多個細胞，脾臟是各種免疫細胞的熱點。細胞可以抵抗感染，但也可以提供日常免疫和反應。
不斷開發(fā)新方法，用顯微鏡觀察器官和組織中的微小單細胞。原理是研究生的基本藍圖，也就是DNA以及如何將其包裝在單個細胞中。這個包叫做染色質(zhì)，它指示藍圖中的哪些基因被打開和關閉，從而決定它是變成血細胞、皮膚細胞、免疫細胞、癌細胞還是其他類型的細胞。
Kedar Nath Natarajan說：“我們的新方法描述了單個細胞中的染色質(zhì)，并為現(xiàn)有技術提供了一種強大、可擴展和更便宜的替代方案，現(xiàn)有技術需要昂貴的基礎設施、特殊試劑和設備。
他與韋爾科姆桑格研究所的第一作者陳曦一起，領導了新方法的開發(fā)，并引入了各種細胞，包括免疫細胞、干細胞等。韋爾科姆桑格研究所的另一個貢獻者是里卡多米拉蓋亞，該研究已在通訊作者薩拉泰希曼的實驗室中完成。
本文摘要給出如下描述：
通過測序確定轉座酶可及染色質(zhì)(ATAC序列)被廣泛用于鑒定全基因組中的調(diào)節(jié)區(qū)。然而，由于技術挑戰(zhàn)，很少在單細胞水平上進行研究(scATAC-seq)。在這里，我們開發(fā)了一個簡單而強大的基于板的scATACseq方法，它將前端批處理Tn5標記與單核排序相結合。我們已經(jīng)證明，我們的方法在各種系統(tǒng)中穩(wěn)健地工作，包括來自原代組織的新鮮和冷凍保存的細胞。通過分析3000多個脾細胞，我們鑒定了不同的免疫細胞類型，并揭示了細胞類型特異性調(diào)節(jié)區(qū)和相關轉錄因子。
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