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科學家研究了全球生命組織

當我們想到地球上的生命時,我們可能會想到從動物到細菌的例子。然而,天體生物學家在研究生命時,不僅要考慮單個生物,還要考慮整個生態(tài)系統(tǒng)和生物圈。

在天體生物學中,人們越來越關(guān)注我們所知的生命是否是地球特定進化史的一個怪癖,或者生命是否可能由更普遍的組織原則所支配。

科學家們假設(shè),如果有通用的原理可以解釋地球上所有生命的共同屬性,那么它們可能對所有生命都是通用的,甚至對其他星球上的生命也是通用的。如果有“宇宙生物學”,對于尋找地球之外的生命,在實驗室設(shè)計合成生命,解決生命起源問題,都將具有重要意義,這樣科學家至少可以預測外星生命的一些屬性。

此前該領(lǐng)域的研究主要集中在生物學中特定的組織層面,如單個生物或生態(tài)群落。這些層次構(gòu)成了一個層級結(jié)構(gòu),其中個體由相互作用的分子組成,而生態(tài)系統(tǒng)則由相互作用的個體組成。

亞利桑那州立大學(ASU)的一個跨學科研究團隊已經(jīng)超越了這個層次的個體層面,研究層次本身,聚焦于整個生物圈。他們的研究成果最近在科學進展發(fā)表。

“為了理解生物學的一般原理,我們必須了解生命系統(tǒng)是如何跨層次組織的,而不僅僅是在給定的層次內(nèi),”ASU超越中心和地球與太空探索學院的主要作者Hyunju Kim說。

通過這項研究,研究小組發(fā)現(xiàn),生物化學在生物和生態(tài)系統(tǒng)兩個層面都受一般組織原則支配?!斑@意味著在行星尺度的生化組織中有一個邏輯,”ASU地球和太空探索學院的合著者哈里森史密斯說。“科學家們長期以來一直在討論這個邏輯,但到目前為止,他們一直在試圖量化它。量化可以幫助我們限制生命在地球上出現(xiàn)的方式?!?

在這項研究中,該團隊使用了28146個帶注釋的基因組和元基因組以及8658個對生化反應進行編目的全球數(shù)據(jù)庫來構(gòu)建生化網(wǎng)絡。通過這樣做,他們發(fā)現(xiàn)了控制生物化學多樣性和網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)的擴展規(guī)則,這些規(guī)則從個體到生態(tài)系統(tǒng)的整個組織層面,然后到整個生物圈都是共享的。

史密斯說:“量化生命的一般原理——不局限于生命樹領(lǐng)域或特定的生態(tài)系統(tǒng)——是一個挑戰(zhàn)。”“通過結(jié)合網(wǎng)絡科學和標度理論的工具,我們可以在使用研究人員編目的大型基因組數(shù)據(jù)集的同時做到這一點。”

由Kim和Smith領(lǐng)導的研究團隊,在亞利桑那州立大學地球與空間探索與超越中心的Sarah Walker的監(jiān)督下,還包括超越中心的Cole mathis、亞利桑那州立大學物理系(現(xiàn)為格拉斯哥大學)和地球與空間探索研究所的Jason Raymond。

沃克說:“在全球范圍內(nèi)理解生物化學的組織原理,可以幫助我們更好地理解生命作為一個行星過程是如何運作的?!澳軌蚋鼑栏竦刈R別地球上生命的普遍屬性,也將為天體生物學家提供新的定量工具,指導我們尋找地外生命——無論是在其他世界的實驗室里。”

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