來自加利福尼亞州斯坦福大學(xué)的 Yiran E. Liu 及其同事整合了 11 個公共數(shù)據(jù)集，對來自 7 個國家的 365 名登革熱患者的血液轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了分析。在非重癥患者和進(jìn)展為 SD 的患者之間鑒定出差異表達(dá)基因(DEG)。XGBoost 機器學(xué)習(xí)模型僅使用這些 DEG 對公共數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練，以預(yù)測向 SD 的進(jìn)展。該模型在哥倫比亞的 377 名登革熱患者的前瞻性登記隊列中得到驗證。
研究人員在公共數(shù)據(jù)集中確定了八個與 SD 相關(guān)的 DEG，并建立了一個八基因 XGBoost 模型。在獨立驗證隊列中，該模型準(zhǔn)確預(yù)測 SD 進(jìn)展，敏感性和特異性分別為 86.4% 和 79.7%。鑒于隊列中 SD 病例的比例為 5.8%，八基因模型的陽性和陰性預(yù)測值分別為 20.9% 和 99.0%。臨床預(yù)警信號的敏感性和特異性分別為 77.3% 和 39.7%;相比之下，八基因模型導(dǎo)致需要預(yù)測的數(shù)量減少了 80%(從 25.4 減少到 5.0)。八基因模型在發(fā)熱后的前三天和 SD 進(jìn)展前三天提供了對后續(xù) SD 的準(zhǔn)確預(yù)測。
一位合著者在一份聲明中說： “擁有一種能夠有效預(yù)測哪些患者將發(fā)展為嚴(yán)重登革熱的生物標(biāo)志物也將有助于選擇登革熱患者進(jìn)行旨在評估抗病毒策略的臨床研究。”
幾位作者披露了與生物制藥行業(yè)的財務(wù)聯(lián)系;一位作者擁有專利，并且八基因組已被披露以獲得可能的專利保護。
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