對(duì)改善植物特定性狀感興趣的研究人員現(xiàn)在無(wú)需進(jìn)行任何實(shí)驗(yàn)即可識(shí)別調(diào)節(jié)該性狀表達(dá)的基因。
普渡大學(xué)的 Kranthi Varala 和 10 位合著者在《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》上發(fā)表了新的基于網(wǎng)絡(luò)的調(diào)控基因發(fā)現(xiàn)工具的詳細(xì)信息。 Varala 正在申請(qǐng)一項(xiàng)專(zhuān)利，該專(zhuān)利與經(jīng)濟(jì)上重要的種子油生物合成相關(guān)。
普渡大學(xué)-美國(guó)農(nóng)業(yè)部團(tuán)隊(duì)試圖建立一個(gè)資源，從大量公開(kāi)數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)，快速識(shí)別哪些稱(chēng)為轉(zhuǎn)錄因子的特殊基因調(diào)節(jié)各種植物物種中給定性狀的表達(dá)。
“每項(xiàng)研究都集中在其中的少數(shù)幾個(gè)，”園藝和景觀建筑學(xué)助理教授瓦拉拉說(shuō)。 “我們的前提是，如果我們能夠?qū)⑺袛?shù)據(jù)放入單一分析中，那么我們就可以使用這些數(shù)據(jù)來(lái)構(gòu)建全球性的東西。”
擬南芥作為PNAS研究的模型植物，“但這種方法與擬南芥沒(méi)有任何特異性，”瓦拉拉說(shuō)。 “這種方法足夠通用，你可以從玉米數(shù)據(jù)集開(kāi)始。你可以用水稻、番茄，無(wú)論你正在種植的任何作物，只要你有人們已經(jīng)完成的數(shù)千個(gè)基因表達(dá)測(cè)量?，F(xiàn)在我們對(duì)十多個(gè)物種進(jìn)行了數(shù)以萬(wàn)計(jì)的基因表達(dá)研究。”
為了證明該系統(tǒng)有效，該團(tuán)隊(duì)專(zhuān)注于調(diào)節(jié)植物如何在種子中制造和儲(chǔ)存油的遺傳途徑。研究小組之所以選擇這種性狀，是因?yàn)樗谑称泛蜕锶剂仙a(chǎn)中的重要性，而且涉及的 300 多個(gè)基因已經(jīng)為人所知。
通過(guò)基因操縱植物的轉(zhuǎn)錄因子，研究人員可以增加或減少其種子中產(chǎn)生的油量。
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