凱斯西儲(chǔ)大學(xué)的一組研究人員發(fā)現(xiàn)了一種測(cè)量細(xì)胞中蛋白質(zhì)與核糖核酸結(jié)合的關(guān)鍵特征的方法。這一發(fā)現(xiàn)可以提高我們對(duì)基因功能在癌癥、神經(jīng)退行性疾病或感染中的干擾的認(rèn)識(shí)。
RNA(核糖核酸的縮寫)用于體內(nèi)遺傳指示。RNA結(jié)合蛋白在調(diào)節(jié)基因表達(dá)中起著重要作用。科學(xué)家們已經(jīng)知道，這些蛋白質(zhì)的功能模式取決于它們的“結(jié)合動(dòng)力學(xué)”，它描述了它們?cè)诤颂呛怂岬哪硞€(gè)位點(diǎn)上固定了多長(zhǎng)時(shí)間，以及它們?cè)谠撐稽c(diǎn)上停留了多長(zhǎng)時(shí)間。
到目前為止，研究人員還無法測(cè)量細(xì)胞中核糖核酸結(jié)合蛋白的動(dòng)力學(xué)。然而，凱斯西儲(chǔ)大學(xué)的研究人員已經(jīng)回答了長(zhǎng)期存在的RNA生物學(xué)問題。這些發(fā)現(xiàn)為從生化角度理解細(xì)胞中核糖核酸和蛋白質(zhì)之間的相互作用打開了大門。
通過了解動(dòng)力學(xué)，研究人員可以定量預(yù)測(cè)核糖核酸結(jié)合蛋白如何調(diào)節(jié)成千上萬(wàn)個(gè)基因的表達(dá)，這對(duì)開發(fā)核糖核酸-蛋白質(zhì)相互作用的治療策略非常重要。
該研究的主要作者、生物化學(xué)教授?？斯?lián)P科夫斯基(Eckhard Jankowsky)說：“這項(xiàng)研究標(biāo)志著朝著理解基因功能是如何調(diào)節(jié)的以及如何設(shè)計(jì)方法來糾正這種調(diào)節(jié)錯(cuò)誤邁出了重要一步，例如癌癥、神經(jīng)退行性疾病或感染。他在該大學(xué)醫(yī)學(xué)院任教，并擔(dān)任該大學(xué)核糖核酸科學(xué)和治療中心主任。
他們的研究“細(xì)胞中RNA結(jié)合蛋白的動(dòng)力學(xué)圖譜”發(fā)表在2月10日的《自然》雜志上。這項(xiàng)研究得到了國(guó)家普通醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所和國(guó)家科學(xué)基金會(huì)的支持。
凱斯西儲(chǔ)的合著者是研究助理迪帕克夏爾馬；研究生利亞扎戈?duì)?、馬修布里斯特和葉璇；化學(xué)教授卡洛斯埃斯波-埃爾南德斯；生物化學(xué)副教授，核糖核酸科學(xué)和治療中心成員。
為了測(cè)量核糖核酸結(jié)合蛋白的動(dòng)力學(xué)，研究人員使用激光發(fā)射非常短(飛秒)的紫外脈沖，將稱為DAZL的核糖核酸結(jié)合蛋白與核糖核酸中的成千上萬(wàn)個(gè)結(jié)合位點(diǎn)交聯(lián)。(DAZL是無精子癥的縮寫，它與生殖細(xì)胞的發(fā)育有關(guān)。)然后，他們使用高通量測(cè)序來測(cè)量交聯(lián)RNA隨時(shí)間的變化，并確定了DAZL在數(shù)千個(gè)結(jié)合位點(diǎn)的結(jié)合動(dòng)力學(xué)。
由此產(chǎn)生的“動(dòng)態(tài)景觀”使研究人員能夠解碼DAZL結(jié)合及其對(duì)核糖核酸的影響之間的關(guān)系。
標(biāo)簽：
免責(zé)聲明：本文由用戶上傳，與本網(wǎng)站立場(chǎng)無關(guān)。財(cái)經(jīng)信息僅供讀者參考，并不構(gòu)成投資建議。投資者據(jù)此操作，風(fēng)險(xiǎn)自擔(dān)。 如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除！