獨(dú)特的基因特征可以幫助預(yù)測(cè)對(duì)化療的反應(yīng)

弗朗西斯·克里克研究所的研究人員開(kāi)發(fā)了一種方法，可以幫助預(yù)測(cè)肺癌患者是否會(huì)對(duì)化療產(chǎn)生反應(yīng)，這取決于腫瘤中哪些基因被激活。

近年來(lái)，癌癥研究人員加深了我們對(duì)特定基因突變?nèi)绾斡绊懩[瘤發(fā)展、進(jìn)化和對(duì)治療的反應(yīng)的理解。然而，僅存在突變并不能提供腫瘤生物學(xué)的完整圖景。

在本周發(fā)表在《自然通訊》上的研究中，科學(xué)家們研究了腫瘤內(nèi)不同基因的表達(dá)，這些基因被打開(kāi)或關(guān)閉。

研究人員專注于與 RAS 信號(hào)通路相關(guān)的基因，分析了包含這些基因在癌細(xì)胞中的活性信息的數(shù)據(jù)集。從這些數(shù)據(jù)集中并在 AI 的幫助下，他們編制了84個(gè)基因的獨(dú)特基因特征。

當(dāng)科學(xué)家們回顧性地查看來(lái)自 500 多名已經(jīng)接受過(guò)治療的肺癌患者的數(shù)據(jù)時(shí)，基因特征能夠正確預(yù)測(cè)哪些患者會(huì)從化療中受益，哪些不會(huì)從化療中受益。

克里克癌癥基因生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的共同主要作者和博士后研究科學(xué)家 Sophie de Carné 說(shuō)：“由于提供了許多癌癥療法，并且有更多的藥物正在試驗(yàn)中，因此預(yù)測(cè)哪種療法最有可能發(fā)生癌癥是一個(gè)挑戰(zhàn)。由于我們知道 RAS 信號(hào)傳導(dǎo)涉及各種耐藥機(jī)制，我們希望我們的基因特征將有助于確定可以從特定治療中受益的患者群體。

“與此同時(shí)，要實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)還有很多工作要做。它需要在試驗(yàn)環(huán)境中進(jìn)行測(cè)試，我們也在對(duì)其進(jìn)行調(diào)整，以期使其更易于部署。”

克里克癌癥基因生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的共同主要作者和主要小組負(fù)責(zé)人 Julian Downward 說(shuō)：“我們的工作表明，RAS 信號(hào)通路是解釋為什么肺癌患者對(duì)化療有不同反應(yīng)的關(guān)鍵因素。. 該通路中的基因表達(dá)水平比某些基因突變(包括 KRAS 基因突變)的存在更具決定性。”

克里克生物信息學(xué)和生物統(tǒng)計(jì)學(xué)平臺(tái)的第一作者兼副負(fù)責(zé)人菲利普·伊斯特補(bǔ)充說(shuō)：“由于先進(jìn)的計(jì)算工具，我們可以利用大量現(xiàn)有的癌癥數(shù)據(jù)。這項(xiàng)研究展示了這些數(shù)據(jù)集如何帶來(lái)新的見(jiàn)解有可能改善患者的預(yù)后。”

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