科學(xué)家確定了可靠預(yù)測(cè)對(duì)黑色素瘤免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療反應(yīng)的關(guān)鍵生物標(biāo)志物

免疫檢查點(diǎn)抑制劑 (ICI) 療法是一種治療黑色素瘤的方法，黑色素瘤是最致命的皮膚癌形式，它阻斷腫瘤或免疫細(xì)胞上的蛋白質(zhì)，阻止免疫系統(tǒng)殺死癌細(xì)胞。

雖然這種治療已在晚期黑色素瘤患者中顯示出一些臨床成功，但其療效取決于患者對(duì)治療反應(yīng)的可靠預(yù)測(cè)因子。目前，唯一 FDA 批準(zhǔn)的用于 ICI 黑色素瘤治療的生物標(biāo)志物是腫瘤突變負(fù)荷測(cè)定，但將其與 ICI 聯(lián)系起來的機(jī)制仍不清楚。

然而，新的研究現(xiàn)在提供了新的、可靠的生物標(biāo)志物的證據(jù)，這些生物標(biāo)志物可以使用先進(jìn)的計(jì)算機(jī)技術(shù)預(yù)測(cè)治療反應(yīng)。

在Nature Communications上發(fā)表的一篇論文中，Wistar 的 Ellen 和 Ronald Caplan 癌癥中心分子與細(xì)胞腫瘤發(fā)生項(xiàng)目助理教授 Noam Auslander 博士和 Auslander 實(shí)驗(yàn)室的研究生 Andrew Patterson 確定了 ICI 的新預(yù)測(cè)因子黑色素瘤的治療。

特別是，白細(xì)胞和 T 細(xì)胞增殖調(diào)節(jié)過程中的突變顯示出作為生物標(biāo)志物的潛力，可在多個(gè)不同的黑色素瘤患者數(shù)據(jù)集中可靠和穩(wěn)定地預(yù)測(cè) ICI 治療反應(yīng)。

“這項(xiàng)工作旨在為免疫治療反應(yīng)確定更好和更具生物學(xué)解釋性的基因組預(yù)測(cè)因子，”Auslander 指出。“我們需要更好的生物標(biāo)志物來幫助選擇更有可能對(duì) ICI 治療產(chǎn)生反應(yīng)的患者，并了解哪些因素可以幫助增強(qiáng)反應(yīng)并增加這些數(shù)字。”

使用機(jī)器學(xué)習(xí)和公開可用的去識(shí)別臨床數(shù)據(jù)，研究人員調(diào)查了為什么一些黑色素瘤患者對(duì) ICI 治療有反應(yīng)而其他人沒有。該論文的第一作者 Patterson 詳細(xì)介紹了他們的研究過程涉及在數(shù)據(jù)集上訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)模型以預(yù)測(cè)患者是否對(duì) ICI 治療有反應(yīng)，然后確認(rèn)該模型能夠持續(xù)預(yù)測(cè)對(duì)這種治療的反應(yīng)或抵抗多次其他數(shù)據(jù)集。

研究小組發(fā)現(xiàn)，白細(xì)胞和 T 細(xì)胞增殖調(diào)節(jié)過程中存在一些突變基因，這些基因有助于 ICI 治療反應(yīng)和耐藥性。這些知識(shí)可用于確定目標(biāo)以增強(qiáng)黑色素瘤患者的反應(yīng)或減輕抵抗力。

“與目前的臨床標(biāo)準(zhǔn)方法相比，我們能夠更好地預(yù)測(cè)患者是否會(huì)對(duì) ICI 治療產(chǎn)生反應(yīng)，并提取有助于進(jìn)一步了解 ICI 治療反應(yīng)和抵抗背后的機(jī)制的生物學(xué)信息，”Patterson 解釋說。

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