洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院的研究人員開發(fā)了 GEMLI，這是一種開創(chuàng)性的工具，可以使我們研究細(xì)胞從胚胎狀態(tài)到在體內(nèi)發(fā)揮特殊作用的過程，以及它們?cè)诎┌Y和其他疾病中的變化的研究方式民主化并極大地改善。《自然通訊》報(bào)道了這一進(jìn)展。
在錯(cuò)綜復(fù)雜的生命之舞中，細(xì)胞繁殖和多樣化形成生物體的不同部分，了解每個(gè)細(xì)胞的起源至關(guān)重要。這就是生物學(xué)家所說的“細(xì)胞譜系”——細(xì)胞的家譜。正如您可以追溯到祖父母或更遠(yuǎn)的祖先一樣，科學(xué)家可以追蹤細(xì)胞如何分裂并從單個(gè)“親代”細(xì)胞進(jìn)化為各種“子代”細(xì)胞，每個(gè)子代細(xì)胞在體內(nèi)都有自己的作用。
追蹤細(xì)胞譜系有助于我們了解復(fù)雜的生物體(如人類)如何從單個(gè)受精卵發(fā)育成具有數(shù)萬億個(gè)特化細(xì)胞的生物，以及這個(gè)過程的破壞如何導(dǎo)致癌癥等疾病。然而，該領(lǐng)域面臨著一些重大障礙，主要是因?yàn)樽V系追蹤需要復(fù)雜且勞動(dòng)密集型的技術(shù)。
杰姆利簡(jiǎn)介
現(xiàn)在，由 EPFL 的 Almut Eisele 和 David Suter 領(lǐng)導(dǎo)的科學(xué)家開發(fā)了一種計(jì)算工具，可以計(jì)算出細(xì)胞之間的譜系關(guān)系，而不需要專門的實(shí)驗(yàn)譜系追蹤方法。
該工具名為基于基因表達(dá)記憶的譜系推斷 (GEMLI)，僅需要單細(xì)胞 RNA 測(cè)序 (scRNA-seq) 數(shù)據(jù)，這是一種廣泛使用的技術(shù)，可捕獲單個(gè)細(xì)胞在任何時(shí)間表達(dá)的基因的“快照”。給定時(shí)間。
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