霽彩華年,因夢(mèng)同行—— 慶祝深圳霽因生物醫(yī)藥轉(zhuǎn)化研究院成立十周年 情緒益生菌PS128助力孤獨(dú)癥治療,權(quán)威研究顯示可顯著改善孤獨(dú)癥癥狀 PARP抑制劑氟唑帕利助力患者從維持治療中獲益,改寫(xiě)晚期卵巢癌治療格局 新東方智慧教育發(fā)布“東方創(chuàng)科人工智能開(kāi)發(fā)板2.0” 精準(zhǔn)血型 守護(hù)生命 腸道超聲可用于檢測(cè)兒童炎癥性腸病 迷走神經(jīng)刺激對(duì)抑郁癥有積極治療作用 探索梅尼埃病中 MRI 描述符的性能和最佳組合 自閉癥患者中癡呆癥的患病率增加 超聲波 3D 打印輔助神經(jīng)源性膀胱的骶神經(jīng)調(diào)節(jié) 胃食管反流病患者耳鳴風(fēng)險(xiǎn)增加 間質(zhì)性膀胱炎和膀胱疼痛綜合征的臨床表現(xiàn)不同 研究表明 多語(yǔ)言能力可提高自閉癥兒童的認(rèn)知能力 科學(xué)家揭示人類與小鼠在主要癌癥免疫治療靶點(diǎn)上的驚人差異 利用正確的成像標(biāo)準(zhǔn)改善對(duì)腦癌結(jié)果的預(yù)測(cè) 地中海飲食通過(guò)腸道細(xì)菌變化改善記憶力 讓你在 2025 年更健康的 7 種驚人方法 為什么有些人的頭發(fā)和指甲比其他人長(zhǎng)得快 物質(zhì)的使用會(huì)改變大腦的結(jié)構(gòu)嗎 飲酒如何影響你的健康 20個(gè)月,3大平臺(tái),300倍!元育生物以全左旋蝦青素引領(lǐng)合成生物新紀(jì)元 從技術(shù)困局到創(chuàng)新錨點(diǎn),天與帶來(lái)了一場(chǎng)屬于養(yǎng)老的“情緒共振” “華潤(rùn)系”大動(dòng)作落槌!昆藥集團(tuán)完成收購(gòu)華潤(rùn)圣火 十七載“冬至滋補(bǔ)節(jié)”,東阿阿膠將品牌營(yíng)銷推向新高峰 150個(gè)國(guó)家承認(rèn)巴勒斯坦國(guó)意味著什么 中國(guó)海警對(duì)非法闖仁愛(ài)礁海域菲船只采取管制措施 國(guó)家四級(jí)救災(zāi)應(yīng)急響應(yīng)啟動(dòng) 涉及福建、廣東 女生查分查出608分后,上演取得理想成績(jī)“三件套” 多吃紅色的櫻桃能補(bǔ)鐵、補(bǔ)血? 中國(guó)代表三次回?fù)裘婪焦糁肛?zé) 探索精神健康前沿|情緒益生菌PS128閃耀寧波醫(yī)學(xué)盛會(huì),彰顯科研實(shí)力 圣美生物:以科技之光,引領(lǐng)肺癌早篩早診新時(shí)代 神經(jīng)干細(xì)胞移植有望治療慢性脊髓損傷 一種簡(jiǎn)單的血漿生物標(biāo)志物可以預(yù)測(cè)患有肥胖癥青少年的肝纖維化 嬰兒的心跳可能是他們說(shuō)出第一句話的關(guān)鍵 研究發(fā)現(xiàn)基因檢測(cè)正成為主流 血液測(cè)試顯示心臟存在排斥風(fēng)險(xiǎn) 無(wú)需提供組織樣本 假體材料有助于減少靜脈導(dǎo)管感染 研究發(fā)現(xiàn)團(tuán)隊(duì)運(yùn)動(dòng)對(duì)孩子的大腦有很大幫助 研究人員開(kāi)發(fā)出診斷 治療心肌炎的決策途徑 兩項(xiàng)研究評(píng)估了醫(yī)療保健領(lǐng)域人工智能工具的發(fā)展 利用女子籃球隊(duì)探索足部生物力學(xué) 抑制前列腺癌細(xì)胞:雄激素受體可以改變前列腺的正常生長(zhǎng) 肽抗原上的反應(yīng)性半胱氨酸可能開(kāi)啟新的癌癥免疫治療可能性 研究人員發(fā)現(xiàn)新基因療法可以緩解慢性疼痛 研究人員揭示 tisa-cel 療法治療復(fù)發(fā)或難治性 B 細(xì)胞淋巴瘤的風(fēng)險(xiǎn) 適量飲酒可降低高危人群罹患嚴(yán)重心血管疾病的風(fēng)險(xiǎn) STIF科創(chuàng)節(jié)揭曉獎(jiǎng)項(xiàng),新東方智慧教育榮膺雙料殊榮 中科美菱發(fā)布2025年產(chǎn)品戰(zhàn)略布局!技術(shù)方向支撐產(chǎn)品生態(tài)縱深! 從雪域高原到用戶口碑 —— 復(fù)方塞隆膠囊的品質(zhì)之旅

機(jī)器學(xué)習(xí)可以為材料建模提供大規(guī)模的精確電子結(jié)構(gòu)計(jì)算

物質(zhì)中電子的排列(稱為電子結(jié)構(gòu))在藥物設(shè)計(jì)和能量存儲(chǔ)等基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研究中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。然而,缺乏在不同時(shí)間和長(zhǎng)度尺度上提供高保真度和可擴(kuò)展性的模擬技術(shù)長(zhǎng)期以來(lái)一直是這些技術(shù)進(jìn)步的障礙。

德國(guó)格爾利茨亥姆霍茲德累斯頓-羅森多夫中心(HZDR)高級(jí)系統(tǒng)理解中心(CASUS)和美國(guó)新墨西哥州阿爾伯克基桑迪亞國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的研究人員現(xiàn)已開(kāi)創(chuàng)了一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)的模擬方法取代傳統(tǒng)的電子結(jié)構(gòu)仿真技術(shù)。

他們的材料學(xué)習(xí)算法(MALA)軟件堆??梢栽L問(wèn)以前無(wú)法實(shí)現(xiàn)的長(zhǎng)度尺度。該工作發(fā)表在《npj計(jì)算材料》雜志上。

電子是具有根本重要性的基本粒子。它們之間以及與原子核之間的量子力學(xué)相互作用產(chǎn)生了化學(xué)和材料科學(xué)中觀察到的多種現(xiàn)象。了解和控制物質(zhì)的電子結(jié)構(gòu)可以深入了解分子的反應(yīng)性、行星內(nèi)的結(jié)構(gòu)和能量傳輸以及材料失效的機(jī)制。

科學(xué)挑戰(zhàn)越來(lái)越多地通過(guò)計(jì)算建模和模擬、利用高性能計(jì)算的能力來(lái)解決。然而,實(shí)現(xiàn)具有量子精度的真實(shí)模擬的一個(gè)重大障礙是缺乏將高精度與跨不同長(zhǎng)度和時(shí)間尺度的可擴(kuò)展性結(jié)合起來(lái)的預(yù)測(cè)建模技術(shù)。

經(jīng)典原子模擬方法可以處理大型復(fù)雜系統(tǒng),但其對(duì)量子電子結(jié)構(gòu)的省略限制了其適用性。相反,不依賴于經(jīng)驗(yàn)建模和參數(shù)擬合(第一原理方法)等假設(shè)的模擬方法提供了高保真度,但計(jì)算要求較高。例如,密度泛函理論(DFT)是一種廣泛使用的第一原理方法,它表現(xiàn)出隨系統(tǒng)尺寸的三次縮放,從而將其預(yù)測(cè)能力限制在小尺度上。

基于深度學(xué)習(xí)的混合方法

研究人員團(tuán)隊(duì)現(xiàn)在提出了一種新穎的模擬方法,稱為材料學(xué)習(xí)算法(MALA)軟件堆棧。在計(jì)算機(jī)科學(xué)中,軟件堆棧是算法和軟件組件的集合,它們組合在一起創(chuàng)建用于解決特定問(wèn)題的軟件應(yīng)用程序。

倫茨·費(fèi)德勒博士CASUS的學(xué)生和MALA的主要開(kāi)發(fā)人員解釋說(shuō):“MALA將機(jī)器學(xué)習(xí)與基于物理的方法相結(jié)合來(lái)預(yù)測(cè)材料的電子結(jié)構(gòu)。它采用了一種混合方法,利用一種稱為深度學(xué)習(xí)的既定機(jī)器學(xué)習(xí)方法來(lái)準(zhǔn)確預(yù)測(cè)局部量,并輔以用于計(jì)算感興趣的全局量的物理算法。”

MALA軟件堆棧將空間中原子的排列作為輸入,并生成稱為雙譜分量的指紋,對(duì)笛卡爾網(wǎng)格點(diǎn)周圍原子的空間排列進(jìn)行編碼。MALA中的機(jī)器學(xué)習(xí)模型經(jīng)過(guò)訓(xùn)練,可以根據(jù)該原子鄰域預(yù)測(cè)電子結(jié)構(gòu)。MALA的一個(gè)顯著優(yōu)勢(shì)是其機(jī)器學(xué)習(xí)模型能夠獨(dú)立于系統(tǒng)規(guī)模,使其能夠根據(jù)小型系統(tǒng)的數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練并以任何規(guī)模進(jìn)行部署。

研究小組在其出版物中展示了這一策略的顯著有效性。與傳統(tǒng)算法相比,對(duì)于由多達(dá)數(shù)千個(gè)原子組成的較小系統(tǒng)規(guī)模,他們實(shí)現(xiàn)了1,000倍以上的加速。此外,該團(tuán)隊(duì)還證明了MALA能夠準(zhǔn)確執(zhí)行大規(guī)模電子結(jié)構(gòu)計(jì)算,涉及超過(guò)100,000個(gè)原子。值得注意的是,這一成就是通過(guò)適度的計(jì)算工作實(shí)現(xiàn)的,揭示了傳統(tǒng)DFT代碼的局限性。

CASUS極端條件下物質(zhì)部門(mén)代理系主任AttilaCangi解釋道:“隨著系統(tǒng)規(guī)模的增大和涉及的原子數(shù)量的增加,DFT計(jì)算變得不切實(shí)際,而MALA的速度優(yōu)勢(shì)不斷增強(qiáng)。MALA的關(guān)鍵突破在于其“能夠在本地原子環(huán)境中運(yùn)行,從而實(shí)現(xiàn)精確的數(shù)值預(yù)測(cè),并且受系統(tǒng)尺寸的影響最小。這一突破性的成就開(kāi)啟了曾經(jīng)被認(rèn)為無(wú)法實(shí)現(xiàn)的計(jì)算可能性。”

預(yù)計(jì)將推動(dòng)應(yīng)用研究

Cangi旨在利用機(jī)器學(xué)習(xí)突破電子結(jié)構(gòu)計(jì)算的界限。“我們預(yù)計(jì)MALA將引發(fā)電子結(jié)構(gòu)計(jì)算的變革,因?yàn)槲覀儸F(xiàn)在有一種方法可以以前所未有的速度模擬更大的系統(tǒng)。未來(lái),研究人員將能夠基于顯著的計(jì)算能力解決廣泛的社會(huì)挑戰(zhàn)。改善基線,包括開(kāi)發(fā)新疫苗和新型儲(chǔ)能材料、對(duì)半導(dǎo)體器件進(jìn)行大規(guī)模模擬、研究材料缺陷以及探索將大氣溫室氣體二氧化碳轉(zhuǎn)化為氣候友好礦物質(zhì)的化學(xué)反應(yīng)。”

此外,MALA的方法特別適合高性能計(jì)算(HPC)。隨著系統(tǒng)規(guī)模的增長(zhǎng),MALA可以在其使用的計(jì)算網(wǎng)格上進(jìn)行獨(dú)立處理,從而有效地利用HPC資源,特別是圖形處理單元。

桑迪亞國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的科學(xué)家兼并行計(jì)算專家SivaRajamanickam解釋說(shuō):“MALA的電子結(jié)構(gòu)計(jì)算算法很好地映射到具有分布式加速器的現(xiàn)代HPC系統(tǒng)。分解工作并跨不同網(wǎng)格點(diǎn)并行執(zhí)行的能力加速器使MALA成為HPC資源上可擴(kuò)展機(jī)器學(xué)習(xí)的理想選擇,從而在電子結(jié)構(gòu)計(jì)算中實(shí)現(xiàn)無(wú)與倫比的速度和效率。”

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