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全宏基因組分析有助于識別令人沮喪的腸道微生物

在一項為期三年的研究中,來自 Skoltech、俄羅斯科學院瓦維洛夫普通遺傳學研究所、以 NA Alexeev 命名的莫斯科第一心理健康診所和 Serbsky 聯(lián)邦精神病學和麻醉學醫(yī)學研究中心的研究人員研究了腸道微生物如何重度抑郁癥患者不同于精神健康的人。在分析了腸道微生物組中存在的所有基因后,該團隊確定了一種特定的細菌——普拉梭菌——負責健康和抑郁數(shù)據(jù)集之間最大的功能差異。Biomedicines報道了這些發(fā)現(xiàn),有望用于快速心理健康診斷和“精神生物”藥物治療。

如果你知道與健康人群相比,哪些基因在抑郁癥患者中表現(xiàn)得更小或更大,以及哪些細菌對此負責,你可以嘗試做兩件事。首先,在診斷精神障礙時,可以將糞便微生物群分析作為輔助工具。其次,你可以嘗試開發(fā)能夠使抑郁癥患者的腸道微生物群‘正?;?rsquo;的藥物。”

Alexey Kovtun,研究主要作者,生物研究實習生,Skoltech

為了識別“令人沮喪”的腸道細菌,研究人員進行了所謂的全基因組分析。也就是說,他們從一組被診斷患有重度抑郁癥的患者和一組精神健康個體的糞便樣本中回收并測序了全部細菌 DNA。“結果是我們知道每個組的微生物組中存在哪些基因和細菌種類,以及它們的代表性有多強,”科夫通說。

下一步是確定一組在健康個體和精神障礙患者之間顯著差異的基因,并放大這些特定基因,以找出攜帶它們的細菌中哪些實際上在抑郁癥患者的微生物組中過多或不足.

一種特殊的細菌確實脫穎而出。它被稱為Faecalibacterium prausnitzii,在重度抑郁癥患者的腸道中數(shù)量明顯減少。我們將它與這些患者的微生物組宏基因組中三個嚴重不足的基因組聯(lián)系起來。”

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